11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2224 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2224  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1355    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1881  hypothetical protein  27.15 
 
 		 674 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.393635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  26.8 
 
 		 669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  28.27 
 
 		 692 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1490  hypothetical protein  27.18 
 
 		 664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1462  hypothetical protein  24.19 
 
 		 592 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0152709  normal  0.836043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  25.12 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2898  hypothetical protein  24.8 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319126  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  25.72 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3789  hypothetical protein  27.64 
 
 		 126 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.158808  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  27.06 
 
 		 512 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>