18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2035 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1034    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  46.02 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  36.72 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  35.56 
 
 		 488 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  32.77 
 
 		 485 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  33.82 
 
 		 487 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  25.71 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  25.23 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  25.21 
 
 		 635 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 607 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  26.11 
 
 		 617 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  23.25 
 
 		 609 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1430 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  23.12 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2224  hypothetical protein  25.89 
 
 		 667 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  26.09 
 
 		 692 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  25.84 
 
 		 669 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0241  hypothetical protein  22.22 
 
 		 254 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>