13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3828 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1353    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1462  hypothetical protein  40.37 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0152709  normal  0.836043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  37.08 
 
 		 692 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1490  hypothetical protein  35.78 
 
 		 664 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1881  hypothetical protein  32.86 
 
 		 674 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.393635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2224  hypothetical protein  26.8 
 
 		 667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2898  hypothetical protein  27.49 
 
 		 665 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319126  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  25.97 
 
 		 609 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  28.23 
 
 		 488 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  22.82 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  24.17 
 
 		 487 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  20.83 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  28.87 
 
 		 485 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>