20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1488 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1004    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  37.69 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  35.56 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  33.26 
 
 		 515 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  33.58 
 
 		 485 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  32.27 
 
 		 487 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  29.6 
 
 		 618 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  26.72 
 
 		 609 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  25.65 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1462  hypothetical protein  28.52 
 
 		 592 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0152709  normal  0.836043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  24.92 
 
 		 692 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  26.6 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  28.23 
 
 		 669 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1881  hypothetical protein  23.21 
 
 		 674 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.393635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0241  hypothetical protein  25.71 
 
 		 254 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  23.7 
 
 		 635 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1490  hypothetical protein  25.22 
 
 		 664 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  31.36 
 
 		 3824 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  30.77 
 
 		 3739 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  24 
 
 		 617 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>