11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1881 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 674 aa  1368    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.393635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1490  hypothetical protein  39.7 
 
 		 664 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  33.19 
 
 		 692 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  32.86 
 
 		 669 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1462  hypothetical protein  33.67 
 
 		 592 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0152709  normal  0.836043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2224  hypothetical protein  27.39 
 
 		 667 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2898  hypothetical protein  26.24 
 
 		 665 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319126  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  23.21 
 
 		 488 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  25.59 
 
 		 515 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  21.94 
 
 		 504 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  20.03 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>