20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2226 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1046    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  46.02 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  33.4 
 
 		 504 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  33.26 
 
 		 488 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  30.97 
 
 		 485 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  31.59 
 
 		 487 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  29.65 
 
 		 617 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  27.78 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  30.28 
 
 		 618 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  25.64 
 
 		 602 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  27.13 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1430 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  27.03 
 
 		 692 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1881  hypothetical protein  26.29 
 
 		 674 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.393635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  25.09 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  25.95 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1490  hypothetical protein  24.04 
 
 		 664 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  24.84 
 
 		 669 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3070  hypothetical protein  23.46 
 
 		 355 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  25.09 
 
 		 877 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>