15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3410 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  50.46 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3070  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4028  hypothetical protein  33.91 
 
 		 216 aa  99  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0355  hypothetical protein  31.15 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0241  hypothetical protein  28.92 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  24.14 
 
 		 607 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5183  hypothetical protein  30.96 
 
 		 239 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.836807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  25.86 
 
 		 602 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  26.6 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  23.92 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  26.09 
 
 		 609 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  23.18 
 
 		 539 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  22.33 
 
 		 504 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1430 aa  45.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>