13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1883 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1293    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  35.86 
 
 		 607 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1430 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  31.83 
 
 		 617 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  30.53 
 
 		 602 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  27.48 
 
 		 515 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  26.76 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  24.15 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3070  hypothetical protein  26.52 
 
 		 355 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  27.49 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  28.44 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  30.53 
 
 		 618 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  23.7 
 
 		 488 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>