160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0321 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0321  aminomethyltransferase related to GcvT-like protein  100 
 
 		 247 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011855  hitchhiker  0.0000000103614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0159  hypothetical protein  65.73 
 
 		 255 aa  321  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000279437 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0169  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  65.32 
 
 		 255 aa  316  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1357  glycine cleavage T protein  27.4 
 
 		 313 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13620  ygfZ-like protein  28.47 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0537  glycine cleavage T-protein  28.82 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000137098  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1643  aminomethyltransferase family protein  28.82 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0969533  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1423  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4298  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.34 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4761  hypothetical protein  28.63 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4388  folate-binding protein YgfZ  24.32 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410002  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54480  hypothetical protein  25.91 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2255  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.333338  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1085  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.29 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000414438  hitchhiker  0.0000000121971 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3319  putative global regulator  26.6 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4190  putative global regulator  28.57 
 
 		 326 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1063  hypothetical protein  25.94 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.42 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0811  putative global regulator  25.68 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3031  putative global regulator  27.31 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02730  putative global regulator  26.26 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.302082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0794  folate-binding protein YgfZ  26.26 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02693  hypothetical protein  26.26 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.345451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3057  putative global regulator  26.26 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3225  putative global regulator  26.26 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1463  GcvT-like aminomethyltransferase  25.21 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0953124  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4228  hypothetical protein  25.45 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.88 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1294  aminomethyl transferase  29.41 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2521  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.17 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0149913  hitchhiker  0.00318223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2267  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  35.11 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3385  putative global regulator  26.42 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3962  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.93 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.812707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002488  glycine cleavage T-protein  25.86 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.923355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3205  putative global regulator  26.42 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3283  putative global regulator  26.42 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3280  putative global regulator  26.42 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1946  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.16 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.4 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3414  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.88 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3217  putative global regulator  26.09 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3899  putative global regulator  25.37 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0630  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.98 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.31258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03546  aminomethyltransferase  26.03 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1989  folate-binding protein YgfZ  25.96 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1715  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.96 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.14 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0047  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.4 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.21464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2253  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.85 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.26 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.05 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3431  folate-binding protein YgfZ  27.41 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3316  putative global regulator  26.36 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3840  putative global regulator  24.24 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0875  putative global regulator  24.24 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0637  putative global regulator  24.47 
 
 		 333 aa  62  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1782  hypothetical protein  27.09 
 
 		 346 aa  62  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000345252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4132  putative aminomethyltransferase  25.35 
 
 		 324 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.510492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0872  putative global regulator  23.86 
 
 		 330 aa  62  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0717  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.43 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  24.31 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0851  putative global regulator  26.47 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  25.69 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  26.05 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2049  hypothetical protein  27.03 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3306  folate-binding protein YgfZ  26.05 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0240  hypothetical protein  25.23 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  39.44 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3386  folate-binding protein YgfZ  26.69 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00306542  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0861  hypothetical protein  23.01 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.22 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1432  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.21 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0881  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.33 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.12 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.59 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1876  folate-binding protein YgfZ  26.98 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0515526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1003  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1446  hypothetical protein  25.68 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3305  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.12 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0479  aminomethyltransferase  24.81 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1862  hypothetical protein  26.79 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.171418 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1537  hypothetical protein  26.24 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1468  folate-binding protein YgfZ  36.29 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606747  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.56 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0149  putative global regulator  32.38 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.423985  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1427  folate-binding protein YgfZ  35.48 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345601  normal  0.255059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.65 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.93 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0557  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.83 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1427  hypothetical protein  26.55 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2445  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  26.55 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.17 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1918  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  26.55 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3386  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  26.55 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2283  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  26.55 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2322  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  26.55 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1191  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  26.55 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3198  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.62 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3890  folate-binding protein YgfZ  21.99 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00117726  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0691  folate-binding protein YgfZ  26.44 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>