More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1093 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 540 aa  1090    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.11 
 
 		 540 aa  1014    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159375  normal  0.199661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1493  methyl-accepting chemotaxis protein  73.33 
 
 		 540 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16430  putative chemotaxis transducer  70.3 
 
 		 542 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.889289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.93 
 
 		 540 aa  969    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.138218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.56 
 
 		 540 aa  1008    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1303  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  73.52 
 
 		 540 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00176405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1052  chemotaxis sensory transducer  75.93 
 
 		 540 aa  782    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1429  putative chemotaxis transducer  69.37 
 
 		 542 aa  710    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.52 
 
 		 541 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3973  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.81 
 
 		 606 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259305  normal  0.0136642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3653  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  58.86 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.44224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  58.85 
 
 		 558 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  58.29 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.61 
 
 		 558 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 558 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.16 
 
 		 558 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 558 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.253027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 558 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.6 
 
 		 558 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.72 
 
 		 558 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.72 
 
 		 558 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 		 564 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1462  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 		 564 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.77 
 
 		 622 aa  262  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1674  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.05 
 
 		 696 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.266076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.58 
 
 		 557 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 549 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 549 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 		 661 aa  170  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 		 540 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  34.03 
 
 		 541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.99 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  27.5 
 
 		 544 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.71 
 
 		 542 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 		 544 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.63 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 		 674 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 547 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 		 547 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.48 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.32 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  27.36 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 		 544 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.77 
 
 		 519 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 541 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  27.06 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  27.88 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.83 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 		 644 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.78 
 
 		 541 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  28.35 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  26.63 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  27.49 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 598 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  30.84 
 
 		 541 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 666 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.95 
 
 		 673 aa  156  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.38 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.81 
 
 		 660 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.14 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.27 
 
 		 540 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.52 
 
 		 569 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.7 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  27.95 
 
 		 660 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 679 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 638 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.94 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  27.81 
 
 		 660 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.74 
 
 		 540 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  30.94 
 
 		 629 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.72 
 
 		 566 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.27 
 
 		 543 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 		 417 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  25.59 
 
 		 549 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.53 
 
 		 535 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 570 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  27.12 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 696 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 		 545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 		 566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.31 
 
 		 612 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0159313  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 		 544 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  30.77 
 
 		 549 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.49 
 
 		 533 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 		 639 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  27.64 
 
 		 549 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  30.03 
 
 		 674 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>