More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.3 
 
 		 540 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.93 
 
 		 540 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159375  normal  0.199661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1493  methyl-accepting chemotaxis protein  69.56 
 
 		 540 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1429  putative chemotaxis transducer  97.97 
 
 		 542 aa  1047    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1303  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  69.56 
 
 		 540 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00176405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1052  chemotaxis sensory transducer  71.59 
 
 		 540 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.56 
 
 		 540 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.138218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.74 
 
 		 540 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16430  putative chemotaxis transducer  100 
 
 		 542 aa  1093    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.889289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.41 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3973  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.66 
 
 		 606 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259305  normal  0.0136642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3653  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  59.56 
 
 		 539 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.44224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  57.59 
 
 		 558 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.91 
 
 		 558 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.51 
 
 		 555 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  57.51 
 
 		 546 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.51 
 
 		 558 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.51 
 
 		 546 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  57.51 
 
 		 558 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  57.51 
 
 		 546 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.4 
 
 		 558 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.51 
 
 		 555 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.64 
 
 		 558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.253027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.45 
 
 		 558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.64 
 
 		 558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.32 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.69 
 
 		 558 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.69 
 
 		 558 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 		 411 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 		 564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1462  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 		 564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.77 
 
 		 622 aa  260  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1674  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.55 
 
 		 696 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.266076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 540 aa  200  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.4 
 
 		 557 aa  192  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 547 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 		 540 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 547 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.29 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.81 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  29.95 
 
 		 541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.55 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.41 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  29.75 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  34.69 
 
 		 549 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.75 
 
 		 540 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 673 aa  169  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.81 
 
 		 519 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.98 
 
 		 541 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.72 
 
 		 550 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 644 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.17 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  27.76 
 
 		 541 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  29.5 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  32.14 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 		 425 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.4 
 
 		 540 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 598 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 570 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 		 661 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 520 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  28.45 
 
 		 541 aa  160  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 571 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 		 666 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0365  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 		 548 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28 
 
 		 540 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 533 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  30.9 
 
 		 541 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 		 612 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0159313  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 537 aa  156  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  30.53 
 
 		 544 aa  156  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  27.09 
 
 		 549 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.18 
 
 		 541 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.6 
 
 		 676 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.93 
 
 		 538 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.03 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 		 571 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.2 
 
 		 592 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.85 
 
 		 674 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.13 
 
 		 696 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.48 
 
 		 542 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  31.49 
 
 		 533 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  31.92 
 
 		 658 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 		 636 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.76 
 
 		 546 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.85 
 
 		 660 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  27.6 
 
 		 541 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.09 
 
 		 807 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 		 569 aa  151  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 		 543 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.44 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.92 
 
 		 658 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>