More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3653 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3653  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
539 aa  1077    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.44224  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3973  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  78.66 
 
 
606 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259305  normal  0.0136642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.92 
 
 
541 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1303  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  61.17 
 
 
540 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00176405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1052  chemotaxis sensory transducer  60.62 
 
 
540 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1429  putative chemotaxis transducer  59.38 
 
 
542 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.3 
 
 
540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.138218  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.04 
 
 
540 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.86 
 
 
540 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.86 
 
 
540 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159375  normal  0.199661 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  59.23 
 
 
558 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16430  putative chemotaxis transducer  59.56 
 
 
542 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.889289  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  59.12 
 
 
555 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1493  methyl-accepting chemotaxis protein  60.73 
 
 
540 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  59.12 
 
 
546 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  59.12 
 
 
558 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  59.12 
 
 
546 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  59.12 
 
 
546 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  59.12 
 
 
558 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  59.12 
 
 
555 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.96 
 
 
558 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143114  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.36 
 
 
558 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.59 
 
 
558 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.253027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.59 
 
 
558 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.2 
 
 
558 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.75 
 
 
558 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.04 
 
 
558 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772371  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.83 
 
 
558 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613268  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
411 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1462  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.29 
 
 
564 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.29 
 
 
564 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  44.44 
 
 
622 aa  267  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1674  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.97 
 
 
696 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.266076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 
540 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.71 
 
 
540 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.75 
 
 
542 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.63 
 
 
557 aa  174  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 
540 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.73 
 
 
519 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 
519 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  27.3 
 
 
549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.05 
 
 
525 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 
661 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  29.48 
 
 
543 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 
547 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0912  methyl-accepting chemotaxis protein  27.02 
 
 
551 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.49 
 
 
544 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 
644 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 
547 aa  160  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.41 
 
 
549 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.19 
 
 
571 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.15 
 
 
539 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 
674 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
637 aa  156  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  27.66 
 
 
541 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.65 
 
 
539 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  30.75 
 
 
549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  24.26 
 
 
544 aa  153  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  28.02 
 
 
541 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 
547 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 
666 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 
549 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0785  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 
551 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367078  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.09 
 
 
550 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.8 
 
 
535 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.86 
 
 
550 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 
452 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  27.88 
 
 
541 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 
571 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.23 
 
 
544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.86 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.55 
 
 
540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.87 
 
 
539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  29.03 
 
 
539 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 
541 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  27.65 
 
 
541 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 
598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  26.7 
 
 
541 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.49 
 
 
696 aa  146  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.21 
 
 
528 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 
546 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.74 
 
 
679 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 
541 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 
561 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 
570 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 
417 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  31.67 
 
 
712 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  31.94 
 
 
712 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.82 
 
 
543 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 
518 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.84 
 
 
540 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 
533 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1768  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.61 
 
 
516 aa  143  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  32.59 
 
 
541 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.89 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 
544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0341  methyl-accepting chemotaxis protein  23.43 
 
 
574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 
541 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>