151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0952 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0952  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 281 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0895  cytochrome c assembly protein  76.79 
 
 		 293 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.586988  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1425  HemX protein, putative  76.43 
 
 		 281 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1794  cytochrome c assembly protein  78.54 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1517  HemX protein, putative  64.71 
 
 		 277 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1537  cytochrome c assembly protein  63.53 
 
 		 281 aa  315  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000307971  hitchhiker  0.00260082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0935  cytochrome c assembly protein  56.74 
 
 		 282 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.685136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.11 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.87 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  28.11 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.32 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  29.58 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  29.58 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  30.28 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  27.42 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.36 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  26.29 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.8 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  26.62 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  27.57 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  24.4 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  24.41 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  30.83 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  27.72 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0579  cytochrome c assembly protein  23.19 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  27.32 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  24.68 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.75 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.26 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  22.03 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.8 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  28.08 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.78 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  28.37 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  24.81 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  25.87 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  25.17 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  26.72 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  26.42 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  30.28 
 
 		 401 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  26.67 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  24.44 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  24.47 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.73 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0705  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.09 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  29.36 
 
 		 407 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.68 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  28.16 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  30.28 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  21.28 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  26.57 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.13 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.12 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  26.5 
 
 		 381 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  20.77 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  27.73 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.93 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.93 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.93 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2880  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.43 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.48 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.31 
 
 		 405 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  27.66 
 
 		 472 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.78 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2890  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.3 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0734214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  23.36 
 
 		 395 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.56 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.68 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  25.31 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  24.82 
 
 		 378 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3181  cytochrome c assembly protein  25.83 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.31 
 
 		 401 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  25.93 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  25.93 
 
 		 408 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  25.93 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0159  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  21.33 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  25.93 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.45 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  26.32 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4583  hemX protein  24.17 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.71 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1235  hemX protein  28.78 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.299546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  24.1 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  24.31 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  23.39 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2871  cytochrome c assembly protein  27.1 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4697  hemX protein  24.17 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>