266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1458 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  99.65 
 
 
284 aa  557  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
284 aa  557  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  98.59 
 
 
284 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  76.98 
 
 
283 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  33.2 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.24 
 
 
271 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  34.75 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.46 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  35.38 
 
 
278 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  31.03 
 
 
271 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  37.14 
 
 
240 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  32.23 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.81 
 
 
271 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  34.13 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  35.78 
 
 
276 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  31.82 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  31.58 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  38.1 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.5 
 
 
283 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  32.2 
 
 
366 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.11 
 
 
283 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  32.64 
 
 
284 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.15 
 
 
282 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  31.22 
 
 
284 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  31.56 
 
 
285 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.51 
 
 
282 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.61 
 
 
283 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  30.48 
 
 
278 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  28.46 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.12 
 
 
282 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  28.39 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.38 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  29.3 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.84 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  28.99 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.62 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  25.42 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  28.88 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.79 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.45 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.51 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  33.51 
 
 
395 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33 
 
 
358 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 
301 aa  87  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  29.76 
 
 
341 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  27.63 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  27 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  31.11 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2890  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0734214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  27.69 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.2 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  29.73 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  30.71 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  34.67 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.92 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.95 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  29.28 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.82 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  32.07 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  26.64 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.94 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  30.94 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.16 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  30.05 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.27 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.51 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  31.98 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.12 
 
 
405 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2880  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.02 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.11 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.43 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.6 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.67 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  33.12 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  26.94 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.15 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0579  cytochrome c assembly protein  32.67 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.56 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  31.63 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  31.63 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  31.63 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0705  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.72 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.22 
 
 
395 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  32.89 
 
 
397 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  28.11 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.9 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.11 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  35.58 
 
 
381 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  31.87 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.1 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3558  cytochrome c assembly protein  32 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  38.1 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.1 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  29.84 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  28.77 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  32.08 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>