More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1122 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 277 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  32.38 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  29.08 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.56 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.4 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.89 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  29.11 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  29.63 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  31.67 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  29.86 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.57 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  29.68 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  27.64 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.52 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  31.95 
 
 		 329 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.49 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  26.57 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.93 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.44 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  27.42 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  28.77 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.49 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  27.95 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.81 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  28.44 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  27.54 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  26.27 
 
 		 366 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  26.27 
 
 		 366 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  26.27 
 
 		 366 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.66 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.03 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  26.85 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.02 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  27.62 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.9 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  27.94 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.47 
 
 		 341 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.47 
 
 		 341 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  31.58 
 
 		 378 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.45 
 
 		 340 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  26.12 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.2 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  31.36 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  31.08 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 		 401 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.24 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 		 407 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  30.67 
 
 		 327 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.71 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  30 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  30 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  30 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.59 
 
 		 395 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.37 
 
 		 405 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.84 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.41 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  28.77 
 
 		 391 aa  91.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.64 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  28.37 
 
 		 408 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.3 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  29.3 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.3 
 
 		 396 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  28.37 
 
 		 396 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  25.78 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  25.56 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.59 
 
 		 395 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.45 
 
 		 390 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  29.3 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  28.37 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.3 
 
 		 401 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  28.37 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  41.84 
 
 		 351 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.28 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  30 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.3 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  28.37 
 
 		 396 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  28.37 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  29.3 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  26.03 
 
 		 395 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  29.3 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  28.37 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  28.37 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  25.33 
 
 		 366 aa  89.7  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.94 
 
 		 360 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  30.25 
 
 		 397 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  29.3 
 
 		 403 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.79 
 
 		 351 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  25.11 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  25.11 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  26.82 
 
 		 395 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.33 
 
 		 321 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.04 
 
 		 330 aa  88.6  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  25.32 
 
 		 381 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.79 
 
 		 358 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 341 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.82 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  41.67 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>