270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1617 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  63.33 
 
 		 275 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  57.09 
 
 		 274 aa  325  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  44.44 
 
 		 275 aa  249  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  45.04 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0960  cytochrome c assembly protein  42.03 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  33.09 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  32.83 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  31.6 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  35.47 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  34.35 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.58 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  32.23 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  30.48 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.69 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.46 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.36 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.7 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.39 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.64 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  30.5 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  29.41 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  29.47 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.91 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  30.2 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  30.28 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  33.5 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.53 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.03 
 
 		 333 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.72 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  31.66 
 
 		 391 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  28.95 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.37 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  28.8 
 
 		 378 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  29.11 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  30.45 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  31.66 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  33.99 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  31.41 
 
 		 329 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.65 
 
 		 361 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  30.3 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.42 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  29.87 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  35.57 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.17 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.46 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.92 
 
 		 390 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.65 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.17 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  31.14 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.17 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.68 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  31.14 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  31.14 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.98 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.71 
 
 		 328 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  29.19 
 
 		 283 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  34.01 
 
 		 334 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  34.01 
 
 		 334 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  34.01 
 
 		 334 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  30.3 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  32.7 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  38.89 
 
 		 472 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.17 
 
 		 346 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  39.42 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.64 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  27.98 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  31.74 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.34 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  35.16 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  33.95 
 
 		 255 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  31.45 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  27.75 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  32.26 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.44 
 
 		 405 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  29.78 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  36 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  28.21 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  28.21 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  41.67 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  28.21 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  30.22 
 
 		 360 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.82 
 
 		 349 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.41 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.58 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  29.67 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  42.86 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  28.16 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  28.63 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.21 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  31.58 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  29.21 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.18 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  31.58 
 
 		 401 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.99 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.09 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  31.67 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  28.25 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>