249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2024 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  100 
 
 
274 aa  544  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  61.17 
 
 
275 aa  358  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  56.13 
 
 
276 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  48 
 
 
275 aa  271  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  51.82 
 
 
275 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0960  cytochrome c assembly protein  39.62 
 
 
275 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  34.43 
 
 
278 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  32.7 
 
 
271 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.34 
 
 
271 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  32.82 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.6 
 
 
271 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  36.89 
 
 
240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  31.02 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.21 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  35.29 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.9 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.65 
 
 
283 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  29.37 
 
 
282 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  27.41 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.6 
 
 
284 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.32 
 
 
283 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.02 
 
 
282 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  29.03 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  35.27 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.69 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  32.05 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.27 
 
 
283 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.27 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  33.17 
 
 
284 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.46 
 
 
333 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.41 
 
 
272 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.28 
 
 
323 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  33.15 
 
 
391 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  27.76 
 
 
283 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.23 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  33.16 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  33.33 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.01 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  31.5 
 
 
341 aa  96.3  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  38.18 
 
 
472 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  27.46 
 
 
378 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.15 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.51 
 
 
339 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  30.26 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  29.14 
 
 
324 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  33.15 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  30.54 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  29.94 
 
 
324 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.67 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  31.16 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.87 
 
 
350 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.12 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  32.23 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  29.28 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  29.28 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  28.25 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  29.28 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.32 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.27 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2220  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.68 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.4 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  30.05 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2880  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.86 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.32 
 
 
395 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  28.33 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  30.72 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.21 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  28.33 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.21 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.44 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.12 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  29.28 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  27.89 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  38.95 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.71 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  29.25 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  28.33 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.18 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  36.73 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  26.03 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.24 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  31.68 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  28.65 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  27.37 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  27.37 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  35.2 
 
 
385 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.38 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.65 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.69 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.73 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.73 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  30.38 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  36.46 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  28.25 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1398  cytochrome c assembly protein  34.4 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.720843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>