More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2565 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.15 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  33.6 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  36.52 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.62 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  41.49 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  33.74 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  38.83 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.57 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  32.66 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  37.57 
 
 		 240 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.61 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.23 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  31.77 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  29.08 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  30.61 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  29.08 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.26 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.08 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  29.33 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  29.22 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.06 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.27 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  31.5 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  28.87 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  34.29 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.21 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.44 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  29.18 
 
 		 283 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 		 334 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 		 334 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 		 334 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.12 
 
 		 330 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  28.88 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  28.88 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  28.88 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.6 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.85 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  27.9 
 
 		 396 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  32.56 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  32.56 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  31.62 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.63 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  32.56 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  35.16 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  29.07 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  28.78 
 
 		 397 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.38 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  31.32 
 
 		 391 aa  86.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  31.35 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  30.32 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  30.54 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.35 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  29.41 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  35.51 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.97 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  32.58 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  32.24 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  27.35 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  32.58 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  34.72 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.35 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  29.52 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.47 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  32.21 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.39 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  29.9 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0960  cytochrome c assembly protein  30.49 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  24.68 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.53 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.02 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  28.18 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.53 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  27.02 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.61 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  26.61 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.72 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  27.82 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  26.61 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  31.06 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.51 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  26.72 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.72 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.41 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  27.59 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.65 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  30.67 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  26.61 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  26.61 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  26.61 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  27.91 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  26.61 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.58 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  27.02 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.53 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>