298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0297 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 275 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  63.33 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  61.17 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  50.18 
 
 		 275 aa  271  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  44.16 
 
 		 275 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0960  cytochrome c assembly protein  38.24 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  36.64 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  34.42 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  37.37 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.73 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  32.57 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.34 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.36 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  31.03 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.34 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.18 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  32.98 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.31 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.67 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  30.88 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.6 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  32.56 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.26 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.98 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  32.84 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  29.5 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.51 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  27.7 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.39 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  28.35 
 
 		 378 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.8 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 391 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.38 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  29.27 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.31 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.73 
 
 		 395 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  32.77 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  31.41 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  28.73 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30 
 
 		 330 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  28.95 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  32.22 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  29.95 
 
 		 320 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  32.62 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  28.07 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  28.72 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.25 
 
 		 341 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.25 
 
 		 341 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.46 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  29.94 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  28.9 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.48 
 
 		 405 aa  95.5  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 		 324 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.64 
 
 		 340 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.26 
 
 		 346 aa  95.5  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.7 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  32.58 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  27.17 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.28 
 
 		 390 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  32.95 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  28.89 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  28.2 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  27.65 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.9 
 
 		 350 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  31.58 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  29.94 
 
 		 334 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  29.94 
 
 		 334 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  29.83 
 
 		 328 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  38.18 
 
 		 472 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  29.94 
 
 		 334 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  45.26 
 
 		 351 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.3 
 
 		 395 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  28.89 
 
 		 326 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  30.27 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  43.3 
 
 		 325 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  28.89 
 
 		 326 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  28.89 
 
 		 326 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  30.13 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.3 
 
 		 395 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  29.25 
 
 		 395 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2890  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.04 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0734214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  41.84 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2220  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.71 
 
 		 395 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.71 
 
 		 397 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  28.89 
 
 		 326 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.56 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.42 
 
 		 349 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  44.21 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  27.37 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.13 
 
 		 401 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  31.4 
 
 		 401 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.07 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  33.13 
 
 		 403 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  28.12 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  39.58 
 
 		 385 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  25.37 
 
 		 396 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>