252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0960 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0960  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
275 aa  547  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  42.03 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  40.61 
 
 
275 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  38.24 
 
 
275 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  40 
 
 
274 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  39 
 
 
275 aa  176  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  32.83 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  30.71 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.7 
 
 
271 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.95 
 
 
271 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.08 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  35.61 
 
 
240 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  27.23 
 
 
285 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.99 
 
 
283 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  28.85 
 
 
268 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  38.46 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  27.73 
 
 
282 aa  98.6  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.64 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  27.94 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  32.71 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.3 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.01 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  25.76 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  27.72 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  27.5 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.65 
 
 
333 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  26.06 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.72 
 
 
283 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.46 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  25.46 
 
 
378 aa  89  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  31.22 
 
 
326 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  31.22 
 
 
326 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  31.22 
 
 
326 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.95 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.41 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.1 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  29.71 
 
 
324 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.72 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  32.88 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  30.73 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  32.88 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.02 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  28.14 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  26.79 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  31.51 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.07 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  27.8 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  28.49 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  31.33 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.13 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  28 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  28 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  28 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  27.75 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  31.33 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  22.43 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.87 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.91 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.14 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  27.36 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  27.43 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  27.65 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.69 
 
 
341 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.69 
 
 
341 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.54 
 
 
350 aa  78.6  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  26.09 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.58 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.38 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  38.54 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.29 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  27.93 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  25 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.75 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.52 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  24.58 
 
 
395 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  24.63 
 
 
379 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  35.58 
 
 
351 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.34 
 
 
395 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.34 
 
 
395 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  29.38 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.79 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  39.18 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  25.27 
 
 
395 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  33.65 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.7 
 
 
358 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.02 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  26.86 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  26.86 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  26.86 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  30.25 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.47 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.14 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  28.52 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  28.17 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  28.23 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 
472 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  23.08 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  27.6 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>