More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2890 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2890  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  100 
 
 		 275 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0734214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0594  cytochrome c assembly protein  77.45 
 
 		 275 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0573  cytochrome c assembly protein  62.26 
 
 		 278 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2880  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  58.46 
 
 		 277 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  54.74 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0705  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  52.63 
 
 		 276 aa  292  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0579  cytochrome c assembly protein  38.26 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2871  cytochrome c assembly protein  34.6 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.07 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.64 
 
 		 321 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  28.9 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.05 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.95 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.6 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  29.6 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.76 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  31.44 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.8 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3558  cytochrome c assembly protein  31.05 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  33.62 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.46 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  30.3 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.64 
 
 		 321 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.06 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  33.85 
 
 		 397 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.98 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.78 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.78 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  34.62 
 
 		 326 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  34.07 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 396 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  27.88 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  34.07 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  34.07 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  35.2 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  30.69 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.52 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.96 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  34.09 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  34.09 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  31.3 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  34.09 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  28.31 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  34.09 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  34.84 
 
 		 329 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  33.89 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.19 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.36 
 
 		 346 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.99 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.39 
 
 		 358 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 324 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.5 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 		 396 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.94 
 
 		 396 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.31 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 		 396 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  31.3 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.17 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 		 396 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  29.86 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.94 
 
 		 396 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  30.57 
 
 		 396 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  37.01 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  30.29 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.78 
 
 		 395 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  29.69 
 
 		 366 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  29.69 
 
 		 366 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  29.69 
 
 		 366 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.81 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.87 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  27.24 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  31.78 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  29.46 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.13 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  29.37 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  29.37 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  32.79 
 
 		 378 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  28.36 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.32 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.19 
 
 		 396 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  31.34 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  29.52 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  27.31 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.79 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.68 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  27.31 
 
 		 309 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  29.28 
 
 		 325 aa  99.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  27.9 
 
 		 401 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  29.81 
 
 		 396 aa  99.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  31.11 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.11 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.11 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.96 
 
 		 395 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  32.21 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  29.81 
 
 		 396 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  29.81 
 
 		 396 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>