141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1235 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1235  hemX protein  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.299546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1729  cytochrome c assembly protein  73.23 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.622186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1763  cytochrome c assembly protein  73.23 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2581  cytochrome c assembly protein  32.41 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3181  cytochrome c assembly protein  29.07 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4310  cytochrome c assembly protein  29.07 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4583  hemX protein  28.68 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4556  hemX protein  28.68 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4362  hemX protein  28.68 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4198  hemX protein  28.68 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4209  hemX protein  28.68 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4697  hemX protein  28.68 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4552  hemX protein  28.68 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0651  hemX protein  27.91 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4601  hemX protein  28.68 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0871  cytochrome c assembly protein  29.92 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1839  cytochrome c assembly protein  25.25 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  26.7 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  24.12 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.29 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  25.38 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  26.57 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.81 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.77 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.1 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  28.65 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  24.63 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.64 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.54 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  25.76 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  24.59 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  25.11 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.1 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  27.91 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  22 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.67 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  23.83 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.99 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  22.78 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  21.97 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.41 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  27.41 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  20.74 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  23.36 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  23.36 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.8 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  23.36 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  23.58 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  22.69 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0159  cytochrome c assembly protein  31 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.05 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.37 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  22.27 
 
 		 366 aa  53.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.97 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  23.36 
 
 		 327 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  29.61 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  23.64 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.93 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.32 
 
 		 323 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  22.64 
 
 		 391 aa  52.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.26 
 
 		 390 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0429  cytochrome c assembly protein  25.4 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000010559  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1517  HemX protein, putative  27.42 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  23.95 
 
 		 381 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  23.53 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  22.16 
 
 		 395 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.83 
 
 		 405 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.53 
 
 		 395 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0960  cytochrome c assembly protein  23.4 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.9 
 
 		 330 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  22.45 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  22.45 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  22.45 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.92 
 
 		 333 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  21.28 
 
 		 341 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.25 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  24.18 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  27.31 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  26.56 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  26.95 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  25.2 
 
 		 401 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  23.74 
 
 		 407 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  26.62 
 
 		 472 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.15 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  26.91 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0952  cytochrome c assembly protein  28.78 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  20.74 
 
 		 325 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  20.56 
 
 		 373 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  25.31 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  25.2 
 
 		 396 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  27.44 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.52 
 
 		 395 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  23.84 
 
 		 395 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  25.2 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  26.09 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  25.2 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  25.2 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4384  cytochrome c assembly protein  25.2 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00997476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.2 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.2 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>