238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0429 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0429  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000010559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  27.67 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  26.77 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  28.05 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  26.59 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.8 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.35 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  26.29 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.24 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  25.6 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.05 
 
 		 309 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.05 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  26.4 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  29.13 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.86 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.95 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  27.2 
 
 		 282 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.48 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.44 
 
 		 395 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  27 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  24.15 
 
 		 407 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.95 
 
 		 284 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  23.77 
 
 		 395 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  23.77 
 
 		 401 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  26.34 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.05 
 
 		 395 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  25.86 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  26.92 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  25.66 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  25.34 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  23.02 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  27.06 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  23.66 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  29.71 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  27.34 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  25.63 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  28.47 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  24.44 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  30.86 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.46 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  30.92 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.8 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.8 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.68 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  21.8 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  21.8 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.43 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  21.8 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.97 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.43 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  21.43 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  23.97 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.73 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  24.81 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  22.88 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.7 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  24.57 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.69 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  27.63 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  21.43 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  21.59 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.1 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  25.79 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  21.8 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  21.43 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  21.43 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  21.43 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  21.43 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  21.43 
 
 		 408 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.98 
 
 		 358 aa  75.5  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  21.43 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  22.47 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  25.49 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.32 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  23.4 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  24.15 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.62 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.47 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  27.5 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  29.58 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  25.1 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  25.23 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  25.23 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  25.23 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.33 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.33 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  22.18 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  20.22 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.09 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  24.12 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.96 
 
 		 390 aa  72  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  28.87 
 
 		 328 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  23.01 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  24.62 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  24.44 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>