149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1537 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1537  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 281 aa  548  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000307971  hitchhiker  0.00260082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0935  cytochrome c assembly protein  74.01 
 
 		 282 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.685136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0952  cytochrome c assembly protein  61.57 
 
 		 281 aa  352  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1425  HemX protein, putative  61.79 
 
 		 281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0895  cytochrome c assembly protein  63.21 
 
 		 293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.586988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1794  cytochrome c assembly protein  63.6 
 
 		 262 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1517  HemX protein, putative  55.51 
 
 		 277 aa  314  9e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.19 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  31.11 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.82 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  25.71 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.64 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  29.15 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  27.46 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  27.46 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  27.46 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.39 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.88 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  24.88 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.71 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  27.33 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  29.63 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  24.04 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.36 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  23.27 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  28.41 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.68 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  27.6 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  24.3 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  26.2 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  26.14 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  26.14 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  26.14 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  24.26 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.14 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.14 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.14 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  26.46 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  24.88 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.16 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  27.57 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.06 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.57 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  25.57 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  25.57 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  25.57 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  25.57 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  25.57 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  25.57 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  25.57 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  26.87 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  25.57 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  25.74 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  24.4 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  25.4 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.41 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  25.84 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  25.57 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  30.1 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  29.63 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.57 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.88 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  28.04 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.19 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.13 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  28.4 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.26 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  25.3 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  25.4 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  26.97 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.92 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0579  cytochrome c assembly protein  22.1 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  23.11 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  25.28 
 
 		 381 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  29.51 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.6 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  26.19 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2890  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.32 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0734214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  32 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.12 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.57 
 
 		 405 aa  52.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  27.36 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  24.26 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  28.97 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2880  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  24.63 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  26.67 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  25.48 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.46 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  27.59 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  25.76 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.57 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.52 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.52 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  31.52 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  31.37 
 
 		 444 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.82 
 
 		 339 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.81 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  23.4 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  26.46 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>