41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0935 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0935  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1384  protein of unknown function DUF472  36.95 
 
 
304 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  30 
 
 
877 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  27.43 
 
 
872 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  26.39 
 
 
870 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.11 
 
 
844 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  25.28 
 
 
866 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  28.47 
 
 
844 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  33.02 
 
 
896 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  28.09 
 
 
879 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  32.93 
 
 
723 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  23.25 
 
 
556 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  23.25 
 
 
556 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  32.11 
 
 
850 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  27.04 
 
 
881 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  28.16 
 
 
852 aa  46.2  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  28.84 
 
 
880 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  28.84 
 
 
880 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  28.84 
 
 
880 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  27.04 
 
 
881 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  27.17 
 
 
880 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  21.86 
 
 
858 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  26.49 
 
 
557 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  28.12 
 
 
869 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  26.12 
 
 
917 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  31.53 
 
 
867 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  33.06 
 
 
850 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  32.31 
 
 
864 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  25.82 
 
 
568 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  31.53 
 
 
867 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  34.18 
 
 
839 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  27.82 
 
 
880 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  23.68 
 
 
862 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  26.05 
 
 
877 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  26.05 
 
 
877 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  27.82 
 
 
880 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.12 
 
 
851 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  36.67 
 
 
864 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 
1120 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.86 
 
 
861 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 
1113 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>