More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1271 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1271  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 171 aa  337  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 113 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1992  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 99 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0074793  normal  0.250036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0356  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  40.45 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1786  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0401434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0848  histone-like DNA-binding protein  44.71 
 
 		 102 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 95 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  44.21 
 
 		 95 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 94 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1724  histone-like DNA-binding protein  44.32 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.142965  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  46.07 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  40.34 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0424  histone family protein DNA-binding protein  43.18 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  41.11 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  45.63 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0461  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.376006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  45.65 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  40 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  44.21 
 
 		 138 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 94 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 94 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 94 aa  73.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  40.59 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  44.21 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  40.59 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  42.7 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2910  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.351014  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  44.9 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  41.84 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  41.11 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  44.44 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1426  histone family protein DNA-binding protein  43.53 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  43.33 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  42.7 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  44.44 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  43.33 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  41.3 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  43.33 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A08  nucleoid DNA-binding protein  42.71 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00440163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  41.84 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  38.14 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1244  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.50556  normal  0.20479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  43.33 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  42.22 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  39.18 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 93 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  41.67 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  42.11 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  42.11 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  35.96 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  42.11 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2591  integration host factor, alpha subunit  34.83 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.3815  normal  0.0354419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>