More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1244 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1244  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  183  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.50556  normal  0.20479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2910  histone family protein DNA-binding protein  94.51 
 
 		 91 aa  176  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.351014  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2063  histone family protein DNA-binding protein  84.62 
 
 		 91 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0888639  normal  0.0279949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2761  histone family protein DNA-binding protein  84.62 
 
 		 91 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.680423  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  50.55 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3026  hypothetical protein  48.35 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2884  hypothetical protein  48.35 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 98 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 98 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 98 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  42.86 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0262  integration host factor beta-subunit  46.15 
 
 		 112 aa  84.3  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1931  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  46.67 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  45.05 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  45.65 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  43.48 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00916  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00923  hypothetical protein  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.294308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1073  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000522422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2684  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193078  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2416  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000431379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2208  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000105854  normal  0.266842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1009  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000570398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1080  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0899853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0988  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.165109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1015  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1047  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.788464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1095  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.939272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2236  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00572513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  47.25 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 92 aa  80.1  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  47.73 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  45.45 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2004  integration host factor subunit beta  46.24 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.143906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1736  integration host factor subunit beta  46.24 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.060047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2667  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00090839  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1956  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000034151  normal  0.296627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2579  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000135913  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2338  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>