64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2151 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2151  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6231  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  57.86 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.68 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4358  uracil-DNA glycosylase superfamily  41.22 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6749  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  40.36 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2271  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.14 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4484  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.84 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1812  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.58 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2122  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.84 
 
 		 188 aa  84  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1752  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.24 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.283684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1918  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  37.41 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0564562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0782  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.01 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5004  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.57 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0669859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3474  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.89 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14265  normal  0.104985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1727  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.19 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0576  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  34.01 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.03 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02938  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.54 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.443726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.05 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4301  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.17 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0631  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.54 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3504  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.54 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.294302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02888  hypothetical protein  31.54 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.502644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0547  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.33 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0527787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0632  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.54 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0501283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3533  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.54 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0137464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3362  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.54 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.154156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3249  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.54 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.472365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4381  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.54 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0975894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4482  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  35.53 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0939  Uracil-DNA glycosylase superfamily  33.99 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6106  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  33.11 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6055  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.69 
 
 		 297 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.65 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.63165 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2776  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.88 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2162  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.88 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2870  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.7 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.077705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3712  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  30.52 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6655  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  0.066792 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00820  expressed protein  31.93 
 
 		 469 aa  68.2  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3466  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.89 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4416  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  31.65 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.997938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3568  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.89 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.331488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3398  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.89 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3402  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.89 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3472  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.89 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.189188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.76 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3739  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.48 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6125  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.82 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22360  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  31.72 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1119  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.72 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220864 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05479  mismatch-specific thymine-DNA glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13340)  30.51 
 
 		 389 aa  51.6  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16040  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  39.73 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19740  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  42.03 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00332504  normal  0.0115299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  30.89 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.9 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  30.08 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55251  predicted protein  22.65 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254148  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  38.24 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  30.6 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  32.61 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  32.38 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  31.51 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>