65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6231 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6231  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 166 aa  336  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2151  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.86 
 
 		 176 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.03 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4358  uracil-DNA glycosylase superfamily  41.98 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1918  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  38.71 
 
 		 212 aa  92  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0564562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1727  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38 
 
 		 200 aa  88.2  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2271  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.36 
 
 		 169 aa  87.4  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.62 
 
 		 186 aa  84.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4484  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.86 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6749  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  36.13 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5004  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.78 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0669859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1812  Uracil-DNA glycosylase superfamily  33.12 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1752  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.86 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.283684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3474  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.56 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14265  normal  0.104985 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.42 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2122  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.01 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0631  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.64 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3504  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.64 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.294302  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3533  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.64 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0137464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02888  hypothetical protein  32.64 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.502644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3362  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.64 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.154156  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02938  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.64 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.443726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0632  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.64 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0501283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0547  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.43 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0527787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6055  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.56 
 
 		 297 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3249  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.64 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.472365  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3568  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.88 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.331488 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.78 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.63165 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3402  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.88 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4482  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  33.33 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4381  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.94 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0975894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3398  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.88 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3466  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.88 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3472  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.88 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.189188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2162  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.65 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2776  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.65 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6106  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  33.56 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0782  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.08 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0576  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  31.97 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6655  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.32 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  0.066792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3739  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.11 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.67 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4416  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  33.53 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.997938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3712  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  31.82 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0939  Uracil-DNA glycosylase superfamily  33.11 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2870  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.44 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.077705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6125  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.4 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00820  expressed protein  30.17 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4301  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.03 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1119  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.41 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220864 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22360  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  28.97 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05479  mismatch-specific thymine-DNA glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13340)  27.11 
 
 		 389 aa  51.2  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  28.95 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  30.4 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  34.94 
 
 		 196 aa  44.7  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  32.47 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19740  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  38.36 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00332504  normal  0.0115299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  26.89 
 
 		 174 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  46.15 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  28.97 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  46.15 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  46.15 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  26.32 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16040  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  36.51 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  29.79 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>