63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3739 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3739  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
181 aa  357  7e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2271  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.7 
 
 
169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6749  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  48.99 
 
 
208 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1812  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.63 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0668413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4484  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.66 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.28 
 
 
177 aa  121  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1918  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  46.67 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0564562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0782  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  39.46 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6106  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  44.3 
 
 
210 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0547  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  39.46 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0527787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.95 
 
 
176 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.63165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1752  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.57 
 
 
197 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.283684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1727  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.97 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500879  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5004  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.77 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0669859 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2776  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.95 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.71 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2162  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.95 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2122  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.74 
 
 
188 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4301  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  40 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3474  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  40.14 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14265  normal  0.104985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3712  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  46.31 
 
 
188 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4482  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  41.89 
 
 
197 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.27 
 
 
186 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6055  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.94 
 
 
297 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6125  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.14 
 
 
171 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0939  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.94 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0576  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  40.27 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6655  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.46 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  0.066792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3466  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.81 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3402  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.81 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3398  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.81 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3472  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.81 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.189188  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3568  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.81 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.331488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4416  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  35.23 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.997938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2870  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.25 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.077705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3249  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.27 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.472365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4381  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.27 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0975894  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02888  hypothetical protein  34.27 
 
 
168 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.502644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0631  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.27 
 
 
168 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22360  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  40.35 
 
 
193 aa  92  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3504  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.27 
 
 
168 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.294302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02938  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.27 
 
 
168 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.443726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0632  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.27 
 
 
168 aa  92  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0501283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3362  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.27 
 
 
168 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.154156  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3533  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  34.27 
 
 
168 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0137464  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05479  mismatch-specific thymine-DNA glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13340)  35.43 
 
 
389 aa  89  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554142  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1119  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.64 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19740  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  41.1 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00332504  normal  0.0115299 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16040  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  43.17 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2151  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.48 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.725058  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00820  expressed protein  32.74 
 
 
469 aa  65.1  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.76 
 
 
195 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55251  predicted protein  23.62 
 
 
270 aa  57.8  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254148  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6231  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  33.11 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  28.16 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4358  uracil-DNA glycosylase superfamily  25.17 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  30.25 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>