56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2271 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2271  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 		 169 aa  334  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6749  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  61.35 
 
 		 208 aa  197  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4484  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.9 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1752  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.83 
 
 		 197 aa  184  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.283684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1918  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  63.4 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0564562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6055  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.99 
 
 		 297 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0576  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  51.81 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1812  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.94 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1727  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.28 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.93 
 
 		 190 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0782  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  50 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0547  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  48.61 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0527787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0939  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.3 
 
 		 193 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3249  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  49.31 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.472365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3474  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  49.31 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14265  normal  0.104985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.53 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02888  hypothetical protein  47.17 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.502644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3504  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  47.17 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.294302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3362  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  49.31 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.154156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0631  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  47.17 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02938  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  47.17 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.443726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0632  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.17 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0501283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3712  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  51.92 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3533  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  47.17 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0137464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3568  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  50.69 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.331488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3398  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  50.69 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3402  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  50.69 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3466  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  50.69 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3472  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  50.69 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.189188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6106  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  51.27 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4381  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  48.61 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0975894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4301  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  45.86 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2162  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.69 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2776  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.69 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2122  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.3 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6655  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.5 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  0.066792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.43 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.63165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3739  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.7 
 
 		 181 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4482  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  45.12 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5004  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.25 
 
 		 179 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0669859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6125  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.44 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4416  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  45.66 
 
 		 190 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.997938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22360  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  45.51 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.31 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16040  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  51.37 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1119  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.77 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19740  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  44.38 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00332504  normal  0.0115299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2870  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.9 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.077705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2151  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.14 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00820  expressed protein  40.54 
 
 		 469 aa  95.1  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05479  mismatch-specific thymine-DNA glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13340)  32.39 
 
 		 389 aa  85.1  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.08 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6231  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  38.36 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4358  uracil-DNA glycosylase superfamily  29.25 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904207  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55251  predicted protein  22.36 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254148  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  33.78 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>