85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1718 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2151  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.68 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4358  uracil-DNA glycosylase superfamily  41.82 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6231  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  43.03 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1812  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.2 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4482  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  36.36 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.36 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2122  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.12 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1727  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.93 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6749  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  32.97 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1918  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  32.95 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0564562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0782  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.13 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2568  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.36 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0547  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.46 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0527787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2271  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.08 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6106  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  33.57 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6655  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.93 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  0.066792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4484  Uracil-DNA glycosylase superfamily  33.33 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5004  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.93 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0669859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3533  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.82 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0137464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6125  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.41 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4301  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.17 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3472  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.45 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.189188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3466  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.45 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3402  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.45 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3398  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.45 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3568  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.45 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.331488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3504  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.17 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.294302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0631  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.17 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02888  hypothetical protein  31.17 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.502644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3249  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.82 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.472365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02938  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.17 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.443726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0632  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.17 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0501283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3362  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.17 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.154156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2870  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.43 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.077705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4416  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  30.46 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.997938 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4381  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  29.87 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0975894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1752  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.12 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.283684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3474  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  28.95 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14265  normal  0.104985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2162  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.07 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2776  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.07 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.37 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.63165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0576  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  33.12 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00820  expressed protein  31.19 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1119  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.51 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3739  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.76 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0939  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.45 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6055  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.08 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3712  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  29.27 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  27.63 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.276388 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05479  mismatch-specific thymine-DNA glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13340)  30.77 
 
 		 389 aa  53.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19740  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  28.21 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00332504  normal  0.0115299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.65 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.11 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  31.43 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  35.82 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  29.8 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.87 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  31.01 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  29.8 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  31.43 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.48 
 
 		 167 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  34.33 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  29.01 
 
 		 165 aa  44.7  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  30.68 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  26.16 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  26.47 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  29.8 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  29.8 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  29.69 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  29.8 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.37 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  31.08 
 
 		 157 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  25.55 
 
 		 171 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  29.8 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  31.94 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  29.8 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  29.8 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  29.8 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  29.8 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  30.71 
 
 		 157 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  30.34 
 
 		 158 aa  41.2  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  30.95 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>