38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1404 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1404  type II secretion system protein  100 
 
 
248 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.733447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1871  type II secretion system protein  96.37 
 
 
248 aa  407  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0937784  normal  0.742106 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  60.53 
 
 
256 aa  251  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  27.4 
 
 
295 aa  85.5  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  26.53 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  34.74 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  22.86 
 
 
328 aa  55.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  23.73 
 
 
644 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  23.47 
 
 
450 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.15 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  27.42 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  25.41 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  27.87 
 
 
325 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  22.65 
 
 
335 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  21.01 
 
 
807 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  31.15 
 
 
336 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  29.7 
 
 
325 aa  45.4  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  25.31 
 
 
325 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  25.31 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  25.31 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  31.11 
 
 
336 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  25.31 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.83 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.87 
 
 
325 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.83 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  31.48 
 
 
310 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  27.87 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  29.55 
 
 
321 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  27.2 
 
 
327 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  27.2 
 
 
327 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  27.54 
 
 
325 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  29.75 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  24.44 
 
 
349 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  32.67 
 
 
330 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  27.78 
 
 
313 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  28.43 
 
 
325 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  20.75 
 
 
660 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.89 
 
 
337 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>