69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2282 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  100 
 
 		 77 aa  157  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  42.47 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  47.3 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  45.95 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  44.59 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  46.25 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  45.95 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  40.54 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  40.28 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  47.22 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  47.14 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  46.48 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  39.74 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  44.29 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  39.44 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  35.44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  40.79 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  35.21 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  40.3 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  33.78 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  33.8 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  36.11 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  36.11 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  31.51 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  35.38 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  31.33 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  35.37 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  42.25 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  29.87 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  47.62 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  30.43 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  27.4 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  29.58 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  32.86 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  27.4 
 
 		 87 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  25.97 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  34.25 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  39.71 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  29.17 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  32.35 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  27.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  26.32 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  30.43 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  41.3 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  32.88 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  33.8 
 
 		 84 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  33.8 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  33.8 
 
 		 84 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  33.8 
 
 		 84 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  37.31 
 
 		 86 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  31.25 
 
 		 88 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  33.8 
 
 		 84 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>