73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1011 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  100 
 
 		 78 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  97.44 
 
 		 78 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  89.74 
 
 		 78 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  88.46 
 
 		 78 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  87.18 
 
 		 78 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  87.18 
 
 		 78 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  89.47 
 
 		 84 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  89.47 
 
 		 84 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  89.47 
 
 		 84 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  89.47 
 
 		 84 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  89.47 
 
 		 84 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  87.18 
 
 		 80 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  89.47 
 
 		 80 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  88.16 
 
 		 84 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  59.21 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  63.08 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  57.14 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  57.58 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  44.05 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  45.33 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  44.59 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  46.75 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  45.45 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  40.91 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  47.3 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  46.75 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  47.95 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  38.16 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  44.29 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  42.47 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  44.12 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0259  glutaredoxin 2  47.3 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  39.44 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  38.03 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  34.72 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 79 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  35.62 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  35.29 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  37.84 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  45.57 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  38.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  39.73 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  38.81 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  39.19 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  32 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  39.02 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  44.26 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  36.84 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  45.61 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  36.25 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  31.67 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  32.91 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1011  glutaredoxin 2  37.8 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  41.54 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  37.68 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  44.16 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3675  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  32.47 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  34.21 
 
 		 81 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  43.4 
 
 		 96 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  32.86 
 
 		 77 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  30.99 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18000  glutaredoxin 2  39.13 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  36.23 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>