31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1649 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  215  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  84.31 
 
 		 102 aa  188  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  59.49 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  38.03 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  46.27 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  39.44 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  39.51 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  39.44 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  38.36 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  36.59 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  35.62 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  38.82 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  31.43 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  34.21 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  34.21 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  37.8 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  31.51 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  37.65 
 
 		 84 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  36.47 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  36.11 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  29.33 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  37.35 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  35.53 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  32.86 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  30 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>