61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1581 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  100 
 
 
80 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  40.28 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  49.33 
 
 
78 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  39.44 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  40.85 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  42.25 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  40.85 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  39.44 
 
 
87 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  38.67 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  38.89 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  42.11 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  39.19 
 
 
77 aa  52  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  39.44 
 
 
81 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  39.19 
 
 
92 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  36.62 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.11 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  34.62 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  37.04 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  38.36 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  41.89 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  38.67 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  37.5 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  40.28 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  37.18 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  36.11 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  40 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  40 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  42.31 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  38.03 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  35.62 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  40 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  42.25 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  37.5 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  42.25 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  36.23 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  40.54 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  35.9 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  43.86 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  42.31 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  35.71 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  36.49 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  38.75 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  32.47 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  31.88 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  38.6 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  40.35 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  38.81 
 
 
87 aa  42  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  35.14 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  31.51 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  33.78 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  42.37 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  31.25 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  30 
 
 
90 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  35.14 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  35.14 
 
 
79 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  35.14 
 
 
79 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  31.17 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  32.47 
 
 
84 aa  40  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18000  glutaredoxin 2  34.67 
 
 
89 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>