50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1094 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  62.5 
 
 		 83 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  67.5 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  60 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  44.29 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  41.67 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  42.03 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  40 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  49.3 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  50.7 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  44.59 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  43.06 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  40.51 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  40 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  38.03 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  41.1 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  36 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  38.03 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  41.33 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  36.49 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  45.07 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  44.12 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  44.78 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  36.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  40.51 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  38.57 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  37.33 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  45.07 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  42.65 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  41.18 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  38.75 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  36.76 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  33.87 
 
 		 81 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  35.14 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  30.67 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  32.94 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  35 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  34.38 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>