65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1552 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  100 
 
 		 80 aa  166  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  67.5 
 
 		 83 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  67.5 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  61.54 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  47.14 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  45.83 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  45.21 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  46.38 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  47.14 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  51.43 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  50 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  44.16 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  46.48 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  40.79 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  43.24 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  44.29 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  50 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  41.43 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  43.06 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  45.59 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  44.93 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  44.93 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  44.93 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  37.04 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  39.44 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  38.89 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  36.05 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  38.33 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  36 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  34.21 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  34.21 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  36.49 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  34.78 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  32.43 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  35.21 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  30.26 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  36 
 
 		 80 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  32.53 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  35.48 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  31.51 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  40 
 
 		 87 aa  40  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 78 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>