44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1649 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  100 
 
 		 79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  94.94 
 
 		 79 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  94.94 
 
 		 79 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  93.67 
 
 		 79 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  82.28 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  81.82 
 
 		 78 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  81.82 
 
 		 78 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  76.62 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  70 
 
 		 80 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  67.5 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  74.14 
 
 		 58 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  52 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  50 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  46.75 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  47.22 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  43.06 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  47.95 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  45.33 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  43.06 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  43.66 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  43.66 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  43.28 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.89 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  38.64 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  42.19 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  40.91 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02011  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin i  45.24 
 
 		 43 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0686532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  35.14 
 
 		 80 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  46 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  37.25 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  33.87 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>