46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2144 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  100 
 
 		 79 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  65.79 
 
 		 78 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  63.29 
 
 		 79 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  53.85 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  55.41 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  57.33 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  56.58 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  57.33 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  48.68 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  47.3 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  55.84 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  55.13 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  53.85 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  58.67 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  49.35 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  55.56 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  51.39 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  49.32 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  50.7 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  51.35 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  49.3 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  46.48 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  49.3 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  45.21 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  46.48 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  44.29 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  47.83 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  43.06 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  43.66 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  45.28 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  38.57 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  38.16 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02011  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin i  48.78 
 
 		 43 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0686532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.22 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  34.67 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  30.86 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 73 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  31.94 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>