53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2660 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  100 
 
 		 78 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  62.82 
 
 		 78 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  63.38 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  56.41 
 
 		 79 aa  95.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  61.25 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  56.41 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  56.41 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  55.84 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  59.72 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  54.55 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  57.75 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  50.63 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  48.05 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  48.68 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  47.5 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  48.61 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  46.25 
 
 		 77 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  46.38 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  47.83 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  46.38 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  42.03 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  39.73 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  39.44 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  40.85 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  39.73 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  42.47 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  42.47 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  38.03 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  40.85 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  35.06 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  40.58 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  39.73 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  40.28 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  35.44 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  36.99 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  34.12 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  36.62 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  36.05 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  39.74 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  38.03 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  31.08 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  34.15 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  38.18 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  32.89 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.86 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  28.21 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  38.46 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  32.91 
 
 		 84 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  29.85 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>