21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1884 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  100 
 
 		 102 aa  214  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  84.31 
 
 		 102 aa  188  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  61.64 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  36.62 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  36.62 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  35.62 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  41.79 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  37.14 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  37.5 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  31.11 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  38.36 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  30.86 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  39.71 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  36.84 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  41.54 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  34.72 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  31.43 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  35.29 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  35.53 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  35.53 
 
 		 79 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>