52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1608 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  100 
 
 		 79 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  98.73 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  97.47 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  84.81 
 
 		 81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  76 
 
 		 87 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  72.22 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  70.27 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  73.24 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  71.83 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  60.81 
 
 		 78 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  67.14 
 
 		 78 aa  93.6  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  56.41 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  61.33 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  57.33 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  56.94 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  52 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  47.3 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  50 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  46.84 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  50.7 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  46.05 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  45.21 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  46.48 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  46.67 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  40.85 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  45.33 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  37.93 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  41.18 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  40.85 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  43.75 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  40.26 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  38.36 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  47.27 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.1 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  31.76 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  34.21 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.25 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  40 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  36.71 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  36.36 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  30.56 
 
 		 191 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  29.73 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  35.53 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>