60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1951 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  100 
 
 
80 aa  163  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  60.76 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  47.95 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  47.95 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  45.71 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  46.15 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  45 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  43.53 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  45.45 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  42.86 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  39.19 
 
 
78 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  37.66 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  37.33 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  37.33 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  37.84 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  37.84 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  37.84 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  37.84 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  37.84 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  37.84 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  37.84 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  30.88 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  37.84 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  40.58 
 
 
101 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  38.82 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  35.62 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  36.11 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  37.84 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  33.33 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  33.77 
 
 
79 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  36.49 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  35.14 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  37.5 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5697  glutaredoxin family protein  34.55 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.411683  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  46.03 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  39.39 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  34.62 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4991  glutaredoxin family protein  32.14 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5226  glutaredoxin family protein  32.14 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  30.26 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5371  glutaredoxin family protein  32.14 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  33.87 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  42.11 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  40 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4830  glutaredoxin family protein  32.73 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5290  glutaredoxin family protein  32.73 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.291889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3684  glutaredoxin 2  23.68 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.796183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4820  glutaredoxin family protein  32.73 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5244  glutaredoxin family protein  32.73 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5255  glutaredoxin family protein  32.73 
 
 
81 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  28.75 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  42.31 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  40 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  35.71 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35557  predicted protein  35.29 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.356085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  38.16 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  37.29 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  32.14 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4933  glutaredoxin 2  31.48 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>