35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0789 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  100 
 
 		 90 aa  176  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  68.6 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21141  thioredoxin family protein  57.29 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  48.91 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1746  thioredoxin family protein  47.83 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  44.94 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  37.11 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04731  thioredoxin family protein  39.18 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0407  hypothetical protein  39.18 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04621  thioredoxin family protein  39.18 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  40 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  49.18 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4055  glutaredoxin 2  40 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  41.76 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  43.68 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  41.43 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  34.83 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  35.87 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  46.03 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  43.75 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  41.54 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  40 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  41.54 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  36.76 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  41.27 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  35.29 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  37.68 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  32.86 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  40.3 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  38.46 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>