20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4152 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  100 
 
 		 91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  61.54 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4055  glutaredoxin 2  59.34 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  59.34 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  61.8 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  59.34 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  56.04 
 
 		 95 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  45.56 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  38.04 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  39.68 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1746  thioredoxin family protein  38.04 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  33.7 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  36.17 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27670  predicted protein  25.66 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21141  thioredoxin family protein  32.97 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  36.21 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  33.71 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  35.87 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  35.94 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  32.2 
 
 		 79 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>