19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1588 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  100 
 
 		 88 aa  176  9e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  68.6 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21141  thioredoxin family protein  57.61 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  51.65 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1746  thioredoxin family protein  50.55 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  48.35 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  36.67 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04731  thioredoxin family protein  38.71 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  46.07 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  40.48 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04621  thioredoxin family protein  36.67 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0407  hypothetical protein  36.67 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  39.33 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4055  glutaredoxin 2  40.79 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  42.17 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  33.71 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  41.67 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>