21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4220 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  100 
 
 
84 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  69.05 
 
 
87 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4055  glutaredoxin 2  66.67 
 
 
87 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  65.52 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  59.34 
 
 
91 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  61.45 
 
 
87 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  60.92 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  54.22 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  37.5 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  37.5 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  31.25 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  38.46 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27670  predicted protein  21.7 
 
 
166 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  34.62 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  36.96 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1746  thioredoxin family protein  35.87 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21141  thioredoxin family protein  31.91 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  35.19 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  31.08 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  32.76 
 
 
87 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>