17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21141 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_21141  thioredoxin family protein  100 
 
 
103 aa  204  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  57.29 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  57.61 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  43.62 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1746  thioredoxin family protein  42.55 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  42.55 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  33.67 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04731  thioredoxin family protein  35 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0407  hypothetical protein  34.69 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04621  thioredoxin family protein  34.69 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  32.97 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  37.36 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  31.87 
 
 
95 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  35.11 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  31.76 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  31.91 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4055  glutaredoxin 2  32.97 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>